Bioreaktory, albo biofermentatory (biofermentory) to naczynia reakcyjne, w których zachodzą wszystkie procesy, tj. reakcje chemiczne i biochemiczne w celu przekształcenia substrat w pożądany produkt końcowy.

Reakcje mogą zachodzić w bioreaktorze dzięki obecności biokatalizatorów, czyli enzymów wyizolowanych z mikroorganizmów, lub samych mikroorganizmów, komórek zwierzęcych lub też roślinnych, albo ich części.